Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnot7Q60809 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnot7Q60809 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnot7Q60809 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnot7Q60809 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnot7Q60809 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnot7Q60809 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnot7Q60809 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnot7Q60809 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnot7Q60809 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnot7Q60809 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnot7Q60809 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnot7Q60809 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnot7Q60809 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cnot7Q60809 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms