Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Samhd1Q60710 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samhd1Q60710 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Samhd1Q60710 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Samhd1Q60710 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms