Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr1h2Q60644 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h2Q60644 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1h2Q60644 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h2Q60644 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms