Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm1Q60636 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm1Q60636 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm1Q60636 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm1Q60636 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prdm1Q60636 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm1Q60636 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms