Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXB2Q5VYV0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXB2Q5VYV0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXB2Q5VYV0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXB2Q5VYV0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms