Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MALRD1Q5VYJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MALRD1Q5VYJ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms