Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
WDR78Q5VTH9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
WDR78Q5VTH9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
WDR78Q5VTH9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
WDR78Q5VTH9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
WDR78Q5VTH9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
WDR78Q5VTH9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms