Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF39

MFSD4B, Sodium-dependent glucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4BQ5TF39 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD4BQ5TF39 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MFSD4BQ5TF39 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD4BQ5TF39 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD4BQ5TF39 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD4BQ5TF39 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD4BQ5TF39 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms