Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNYL2Q5T2Q4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYL2Q5T2Q4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms