Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAD3CQ5T2N8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3CQ5T2N8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3CQ5T2N8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3CQ5T2N8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms