Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUV2

Mycbpap, MYCBP-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbpapQ5SUV2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MycbpapQ5SUV2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MycbpapQ5SUV2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MycbpapQ5SUV2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MycbpapQ5SUV2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MycbpapQ5SUV2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MycbpapQ5SUV2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MycbpapQ5SUV2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MycbpapQ5SUV2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MycbpapQ5SUV2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MycbpapQ5SUV2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MycbpapQ5SUV2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MycbpapQ5SUV2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MycbpapQ5SUV2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MycbpapQ5SUV2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MycbpapQ5SUV2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms