Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme4Q5SSW2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psme4Q5SSW2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psme4Q5SSW2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psme4Q5SSW2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psme4Q5SSW2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psme4Q5SSW2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme4Q5SSW2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme4Q5SSW2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme4Q5SSW2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme4Q5SSW2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psme4Q5SSW2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Psme4Q5SSW2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms