Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NUP188Q5SRE5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP188Q5SRE5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NUP188Q5SRE5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP188Q5SRE5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUP188Q5SRE5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NUP188Q5SRE5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms