Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf12Q5SPL2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf12Q5SPL2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf12Q5SPL2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms