Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav3-1Q5R1I8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav3-1Q5R1I8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms