Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER2Q5QJU3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACER2Q5QJU3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACER2Q5QJU3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACER2Q5QJU3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER2Q5QJU3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms