Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD4BQ5PRF9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMD4BQ5PRF9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMD4BQ5PRF9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms