Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scarf1Q5ND28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scarf1Q5ND28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Scarf1Q5ND28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scarf1Q5ND28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scarf1Q5ND28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scarf1Q5ND28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms