Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXB2

UBE2NL, Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NLQ5JXB2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2NLQ5JXB2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2NLQ5JXB2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NLQ5JXB2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2NLQ5JXB2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms