Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AY761185Q5ERI8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AY761185Q5ERI8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AY761185Q5ERI8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY761185Q5ERI8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AY761185Q5ERI8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AY761185Q5ERI8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AY761185Q5ERI8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AY761185Q5ERI8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AY761185Q5ERI8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms