Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf116Q5BN46 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf116Q5BN46 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms