Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KHDC3LQ587J8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KHDC3LQ587J8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms