Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1BQ53T94 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAF1BQ53T94 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF1BQ53T94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1BQ53T94 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms