Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM3Q53FZ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSM3Q53FZ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM3Q53FZ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms