Protein–RNA interactions for Protein: Q53ET0

CRTC2, CREB-regulated transcription coactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC2Q53ET0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRTC2Q53ET0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRTC2Q53ET0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRTC2Q53ET0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRTC2Q53ET0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRTC2Q53ET0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRTC2Q53ET0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms