Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD4Q53EL6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD4Q53EL6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD4Q53EL6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms