Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP29Q52LW3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARHGAP29Q52LW3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGAP29Q52LW3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP29Q52LW3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms