Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN52Q52LA3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIN52Q52LA3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIN52Q52LA3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.2 ms