Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C2cd3Q52KB6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2cd3Q52KB6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2cd3Q52KB6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2cd3Q52KB6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C2cd3Q52KB6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2cd3Q52KB6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C2cd3Q52KB6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C2cd3Q52KB6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C2cd3Q52KB6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C2cd3Q52KB6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2cd3Q52KB6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C2cd3Q52KB6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2cd3Q52KB6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C2cd3Q52KB6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms