Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM259Q4ZIN3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM259Q4ZIN3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM259Q4ZIN3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM259Q4ZIN3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM259Q4ZIN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms