Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srek1ip1Q4V9W2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srek1ip1Q4V9W2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srek1ip1Q4V9W2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srek1ip1Q4V9W2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms