Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd3l2Q3UXB0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mbd3l2Q3UXB0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms