Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SfswapQ3USH5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SfswapQ3USH5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SfswapQ3USH5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SfswapQ3USH5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SfswapQ3USH5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SfswapQ3USH5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SfswapQ3USH5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SfswapQ3USH5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SfswapQ3USH5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SfswapQ3USH5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SfswapQ3USH5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SfswapQ3USH5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SfswapQ3USH5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SfswapQ3USH5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SfswapQ3USH5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SfswapQ3USH5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms