Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pin1rt1Q3ULQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms