Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf224Q3UIW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf224Q3UIW8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf224Q3UIW8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf224Q3UIW8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf224Q3UIW8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf224Q3UIW8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf224Q3UIW8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf224Q3UIW8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf224Q3UIW8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf224Q3UIW8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf224Q3UIW8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf224Q3UIW8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf224Q3UIW8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms