Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Babam1Q3UI43 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Babam1Q3UI43 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Babam1Q3UI43 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Babam1Q3UI43 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Babam1Q3UI43 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms