Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf44Q3UHJ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf44Q3UHJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf44Q3UHJ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf44Q3UHJ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf44Q3UHJ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf44Q3UHJ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf44Q3UHJ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf44Q3UHJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf44Q3UHJ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf44Q3UHJ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf44Q3UHJ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf44Q3UHJ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf44Q3UHJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf44Q3UHJ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.7 ms