Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx27Q3UHD6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx27Q3UHD6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx27Q3UHD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx27Q3UHD6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx27Q3UHD6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx27Q3UHD6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx27Q3UHD6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx27Q3UHD6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Snx27Q3UHD6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx27Q3UHD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx27Q3UHD6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx27Q3UHD6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx27Q3UHD6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms