Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFB2

Znhit6, Box C/D snoRNA protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit6Q3UFB2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Znhit6Q3UFB2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znhit6Q3UFB2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znhit6Q3UFB2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znhit6Q3UFB2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znhit6Q3UFB2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znhit6Q3UFB2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znhit6Q3UFB2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znhit6Q3UFB2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znhit6Q3UFB2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znhit6Q3UFB2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znhit6Q3UFB2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znhit6Q3UFB2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znhit6Q3UFB2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znhit6Q3UFB2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms