Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtpbp6Q3U6U5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtpbp6Q3U6U5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtpbp6Q3U6U5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtpbp6Q3U6U5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtpbp6Q3U6U5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtpbp6Q3U6U5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gtpbp6Q3U6U5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms