Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VwceQ3U515 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VwceQ3U515 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VwceQ3U515 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VwceQ3U515 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VwceQ3U515 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VwceQ3U515 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
VwceQ3U515 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VwceQ3U515 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VwceQ3U515 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms