Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TraddQ3U0V2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TraddQ3U0V2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TraddQ3U0V2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TraddQ3U0V2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.8 ms