Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psmd1Q3TXS7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psmd1Q3TXS7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psmd1Q3TXS7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psmd1Q3TXS7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Psmd1Q3TXS7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psmd1Q3TXS7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Psmd1Q3TXS7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psmd1Q3TXS7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Psmd1Q3TXS7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psmd1Q3TXS7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psmd1Q3TXS7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psmd1Q3TXS7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psmd1Q3TXS7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psmd1Q3TXS7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psmd1Q3TXS7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psmd1Q3TXS7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Psmd1Q3TXS7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psmd1Q3TXS7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Psmd1Q3TXS7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psmd1Q3TXS7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psmd1Q3TXS7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms