Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
9130409I23RikQ3TS87 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
9130409I23RikQ3TS87 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
9130409I23RikQ3TS87 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
9130409I23RikQ3TS87 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
9130409I23RikQ3TS87 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
9130409I23RikQ3TS87 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
9130409I23RikQ3TS87 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9130409I23RikQ3TS87 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
9130409I23RikQ3TS87 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
9130409I23RikQ3TS87 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
9130409I23RikQ3TS87 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
9130409I23RikQ3TS87 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
9130409I23RikQ3TS87 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
9130409I23RikQ3TS87 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
9130409I23RikQ3TS87 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms