Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3TQQ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3TQQ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q3TQQ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q3TQQ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q3TQQ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3TQQ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Q3TQQ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3TQQ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3TQQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3TQQ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms