Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fam107bQ3TGF2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam107bQ3TGF2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam107bQ3TGF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms