Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Patl1Q3TC46 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Patl1Q3TC46 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Patl1Q3TC46 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Patl1Q3TC46 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl1Q3TC46 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl1Q3TC46 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl1Q3TC46 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms