Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBT3

Tmem173, Stimulator of interferon genes protein, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem173Q3TBT3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem173Q3TBT3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem173Q3TBT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem173Q3TBT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem173Q3TBT3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmem173Q3TBT3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms