Protein–RNA interactions for Protein: Q3E811

RRT15, Regulator of rDNA transcription protein 15, yeastyeast

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT15Q3E811 GAS1YMR307W 1680 nt5.78□□□□□ -1.48
RRT15Q3E811 ITR1YDR497C 1755 nt5.78□□□□□ -1.48
RRT15Q3E811 YDR467CYDR467C 327 nt5.77□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 YFR020WYFR020W 699 nt5.77□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 YJL045WYJL045W 1905 nt5.76□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 LYS20YDL182W 1287 nt5.76□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 NPP2YEL016C 1482 nt5.76□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 PTC6YCR079W 1329 nt5.75□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt5.75□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 SRP102YKL154W 735 nt5.75□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 AAC3YBR085W 924 nt5.75□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 HXT13YEL069C 1695 nt5.75□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 ENO1YGR254W 1314 nt5.74□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 CYC3YAL039C 810 nt5.74□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 YBL095WYBL095W 813 nt5.74□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 MOB1YIL106W 945 nt5.73□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 FET5YFL041W 1869 nt5.73□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 SWM1YDR260C 513 nt5.72□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 ATO2YNR002C 849 nt5.72□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 ADE16YLR028C 1776 nt5.72□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 TMS1YDR105C 1422 nt5.72□□□□□ -1.49
RRT15Q3E811 SER2YGR208W 930 nt5.71□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YCR061WYCR061W 1896 nt5.71□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 PFS2YNL317W 1398 nt5.7□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 HEL1YKR017C 1656 nt5.7□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YCR025CYCR025C 411 nt5.7□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 SLG1YOR008C 1137 nt5.7□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YLR072WYLR072W 2082 nt5.7□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YRF1-1YDR545W 5391 nt5.7□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YRF1-5YLR467W 5391 nt5.7□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YRF1-8YOR396W 5391 nt5.7□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 ERO1YML130C 1692 nt5.69□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 MAS2YHR024C 1449 nt5.69□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YCP4YCR004C 744 nt5.69□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 RSM7YJR113C 744 nt5.69□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 SMC5YOL034W 3282 nt5.68□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YLR280CYLR280C 351 nt5.68□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YNL040WYNL040W 1371 nt5.67□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 PRC1YMR297W 1599 nt5.67□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 HTS1YPR033C 1641 nt5.67□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 CHA1YCL064C 1083 nt5.67□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YIR035CYIR035C 765 nt5.67□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 MRS4YKR052C 915 nt5.67□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YMC2YBR104W 990 nt5.67□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 CMK2YOL016C 1344 nt5.67□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 ADH6YMR318C 1083 nt5.66□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YDR306CYDR306C 1437 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YBR056WYBR056W 1506 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 YGR210CYGR210C 1236 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 RNA170RNA170 169 nt5.65□□□□□ -1.5
RRT15Q3E811 AAT1YKL106W 1356 nt5.65□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 HXT11YOL156W 1704 nt5.65□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 FCP1YMR277W 2199 nt5.65□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 SAM50YNL026W 1455 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 ATP10YLR393W 840 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 MET22YOL064C 1074 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 snR4snR4 186 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 HSV2YGR223C 1347 nt5.64□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 ORT1YOR130C 879 nt5.63□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 YPL108WYPL108W 507 nt5.63□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 YER152CYER152C 1332 nt5.63□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 snR86snR86 1004 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 BUB2YMR055C 921 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 YMR166CYMR166C 1107 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 PDC6YGR087C 1692 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 CKI1YLR133W 1749 nt5.62□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 TRP2YER090W 1524 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 OCH1YGL038C 1443 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 CHS7YHR142W 951 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 YLR460CYLR460C 1131 nt5.61□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 CRN1YLR429W 1956 nt5.6□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 SLM3YDL033C 1254 nt5.59□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 RRT14YIL127C 621 nt5.59□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 EMC3YKL207W 762 nt5.59□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 YMR007WYMR007W 381 nt5.59□□□□□ -1.51
RRT15Q3E811 CAK1YFL029C 1107 nt5.58□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 YBL111CYBL111C 2004 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 ACO1YLR304C 2337 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 ERR3YMR323W 1314 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 ERR1YOR393W 1314 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 ERR2YPL281C 1314 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 TGA1tA(UGC)A 73 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 YJR149WYJR149W 1215 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 YMR253CYMR253C 1245 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 NMD5YJR132W 3147 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 SRM1YGL097W 1449 nt5.57□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 YMR210WYMR210W 1350 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 EHT1YBR177C 1356 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 ECM27YJR106W 2178 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 TOS2YGR221C 1869 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 YER156CYER156C 1017 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 YJL009WYJL009W 327 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 YJL160CYJL160C 864 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 OLA1YBR025C 1185 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 LEA1YPL213W 717 nt5.56□□□□□ -1.52
RRT15Q3E811 ABP1YCR088W 1779 nt5.55□□□□□ -1.52
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