Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdss1Q33DR2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdss1Q33DR2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdss1Q33DR2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdss1Q33DR2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdss1Q33DR2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdss1Q33DR2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdss1Q33DR2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdss1Q33DR2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdss1Q33DR2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms